中山大学和武汉大学都是华南和华中地区的顶尖985高校，两所学校在第二轮双一流建设中各有11个学科入选，数量完全相同，但仔细分析会发现，两校的学科结构和优势领域存在明显差异。
2022年2月教育部公布第二轮双一流建设名单，全国共有147所高校入选，比第一轮增加7所，这一轮评选有个重要变化，就是不再区分一流大学建设高校和一流学科建设高校，所有入选高校统一称为双一流建设高校。
中山大学入选的11个双一流学科分别是：哲学、数学、化学、生物学、生态学、材料科学与工程、电子科学与技术、基础医学、临床医学、药学、工商管理，从学科分布来看，中大的双一流学科明显偏向理学和医学领域，其中理学类占了5个（数学、化学、生物学、生态学、材料科学与工程），医学类占了3个（基础医学、临床医学、药学）。
这样的学科布局和中山大学的办学特色高度吻合，中大目前拥有广州、珠海、深圳三个校区，十家附属医院，医学实力在全国高校中属于第一梯队，学校在第四轮学科评估中，生态学和工商管理获得A+，基础医学、临床医学、药学等10个学科获得A-。
武汉大学入选的11个双一流学科是：理论经济学、法学、马克思主义理论、化学、地球物理学、生物学、土木工程、水利工程、测绘科学与技术、口腔医学、图书情报与档案管理，相比中大，武大的学科分布更加均衡，人文社科类就占了4个（理论经济学、法学、马克思主义理论、图书情报与档案管理），工科类占了3个（土木工程、水利工程、测绘科学与技术）。
值得注意的是，武汉大学在第二轮评选中新增了土木工程和水利工程两个双一流学科，这两个学科都是武大的传统强势领域，特别是水利工程，武大在这个领域的积累可以追溯到上世纪50年代。
从A+学科数量来看，武汉大学明显占优，第四轮学科评估中，武大有4个A+学科：马克思主义理论、地球物理学、测绘科学与技术、图书情报与档案管理，这4个学科全部入选双一流建设名单，中山大学只有2个A+学科：生态学和工商管理。
但中大在A类学科总数上并不逊色太多，武大第四轮评估共有19个A类学科，排名全国第七；中大有14个A类学科，两校的差距主要体现在A+学科数量上。
从综合排名来看，软科2025中国大学排名中，武汉大学位居全国第8，中山大学位居第12，武大的排名比去年上升1位，中大则基本保持稳定，在世界大学学术排名中，中大排名全球第65位，武大排名第81位，中大反而更靠前一些。
两校在师资力量方面都很强，中山大学目前拥有21位两院院士，专任教师4969人，武汉大学在2025年院士增选中表现出色，新增3位院士，分别是物理学院的刘正猷、土木建筑工程学院的刘泉声、测绘学院的姜卫平。
从博士点数量来看，中山大学有57个一级学科博士点，武汉大学有49个，中大的博士点数量更多，这和学校近年来大规模扩张有关，中大目前在校生超过7.2万人，规模在985高校中属于较大的。
两校的地理位置也各有优势，中山大学扎根粤港澳大湾区，深圳校区的建设让学校获得了更多发展资源，武汉大学位于中部核心城市武汉，在长江经济带发展战略中占据重要位置。
对于考生来说，选择这两所学校需要考虑自己的专业方向，如果想学医学、生物学、生态学，中山大学是更好的选择；如果想学法学、测绘、水利工程，武汉大学的优势更明显，两校的化学和生物学都入选了双一流，实力相当，可以根据地域偏好来选择。
第三轮双一流评选预计在2026年启动，届时两校的学科建设成果将再次接受检验，从目前的发展态势来看，两校都在各自的优势领域持续发力，未来的竞争会更加激烈。
