计算药物协同作用指数工具-SynergyFinder




SynergyFinder是用于分析药物联合用药协同作用的在线工具,对于三个药联用的数据分析,可参考以下步骤:
1.数据准备
确保数据格式符合SynergyFinder要求,通常为表格格式,包含药物名称、浓度、响应值(如细胞活力或抑制率)等信息。对于三药联用,需明确每种药物的浓度组合及对应的实验结果。
2.上传数据
访问SynergyFinder官网(https://synergyfinder.org/),选择“表格”或“矩阵”格式上传数据。若为三药联用,需提供完整的剂量-反应矩阵或张量数据,确保包含所有药物组合的浓度和响应值。
3.参数设置
响应类型:选择“%inhibition”(抑制率)或“%viability”(活力),根据实验数据的实际表示方式选择。
曲线拟合算法:默认推荐四参数逻辑回归(LL4),若数据不符合S形曲线,可尝试LOESS或线性回归(LM)。
协同模型:SynergyFinder支持多种协同模型,如Bliss、Loewe、ZIP等,可选择适合数据的模型进行分析。
4.结果解读
协同分数:综合协同作用得分是所有剂量组合的平均值,分数大于10表示协同作用,小于-10表示拮抗作用,介于-10至10之间为加和效应。
协同地图:2D或3D协同图以颜色区分协同(红色)和拮抗(绿色)区域,可通过交互式操作查看具体剂量组合的协同分数。
最具协同作用区域(MSA):显示剂量反应矩阵中协同作用最强的3×3剂量窗口,分数越高协同性越强。
5.进一步分析
浓度加权协同作用:可按浓度加权分析,突出低剂量下的协同作用,减少毒性风险。
参数协同模型(MUSYC):若观察到强协同或拮抗作用,可使用MUSYC模型进一步分析协同作用的机制(如增强效力或功效)。
注意事项:
数据需标准化为基于阳性和阴性对照的细胞活力或抑制率,响应值范围通常在0-100%。
若数据存在缺失值或异常值,可使用工具提供的校正功能进行处理。
分析结果需结合实验设计和生物学背景综合判断,协同分数仅为参考,需进一步验证。#实验室日常 #医学实验 #科研 #药物相互作用 #科研学习 #人类高质量科研工具 #好用的网站建设工具分享 #科研 #日常分享 #生物医学科研